（一）學術著作（Publications）：

（1）期刊論文（Journal Articles）：

1. 〈〈王安石拜昭文相制〉在北宋中晚期經史詮釋中的反響〉，《漢學研究》42:2(June 2024), 93-119。
2. 〈從委諸天命到追究責任：南唐舊臣入宋之後的歷史認知與書寫〉，《漢學研究》38:2(June 2020), 133-170.
3. 〈易代歷史書寫與明中葉蘇州張士誠記憶之復歸〉，《明代研究》33(December 2019), 1-60.
4. 〈身分認同之轉變與歷史書寫：以南唐舊臣鄭文寶為例〉，《新史學》30:2(June 2019), 61-110.
5. “A failed peripheral hegemonic state with a limited mandate of heaven: politico-historical reflections of a survivor of the Southern Tang,” Tsing Hua Journal of Chinese Studies (清華學報) New Series 48:2 (June 2018), 243-285.
6. 〈平反陳東〉，《文史》2017:2 (2017), 157-222. (與蔡涵墨教授合著)
7. 〈北宋前期改作五代史之研究〉，《中國史學》（日本中國史學會）26, (2016), 37-74.
8. “Rehabilitation of Chen Dong,” (written with Charles Hartman), Harvard Journal of Asiatic Studies 75:1 (2015), 77-159.
9. 〈秦檜碑記之謎與歷史〉，《杭州文史》1 (2015), 63-71. (與蔡涵墨教授合著)
10. “Beneficiary Pays: Forging Reciprocal Connections between Private Profit and Public Good in Hydraulic Reform in the Lower Yangzi Delta, 1520s-1640s,” T'oung Pao 98 (2012), 385-438.
11. “Primary Sources for Song History in the Collected Works of Wu Ne," (written with Charles Hartman), The Journal of Song-Yuan Studies 41 (2012), 295-341.
12. 〈聖人復作、水歸其壑：夏原吉治水江南與永樂政權正當性之建立〉，《新史學》 22:4 (2011), 55-108.
13. 〈新近面世之秦檜碑記及其在宋代道學史中的意義〉，（與Charles Hartman教授合著），《宋史研究論叢》12 (2011:12): 1-57.
14. 〈地方性與跨地域性：從「子游傳統」之論述與實踐看蘇州在地文化與理學之競合〉，《中央研究院歷史語言研究所集刊》82:2 (2011): 325-398.
15.  “A Newly Discovered Inscription by Qin Gui: Its Implications for the History of Song Daoxue,” (written with Charles Hartman), Harvard Journal of Asiatic Studies 70:2 (2010): 387-448.
16. 〈新方案與十五世紀晚期江南水利改革〉，《明代研究》15 (2010), 1-35.
17.  “Contending Strategies, Collaboration among Local Specialists and Officials, and Hydrological Reform in the Late-Fifteenth-Century Lower Yangzi Delta,” East Asian Science, Technology and Society: An International Journal 4:2 (2010): 229-253.

（2）專書論文（Book Chapters）：

1. 〈張元奇先生《清外史》導讀〉，收於張元奇，《張元奇集》，頁19-36，新竹：國立清華大學出版社，2022。
2. “As a Sage-king reemerges, All Water Returns to Its Proper Path: Xia Yuanji’s Water Management and the Legitimisation of the Yongle Reign,” in Francesca Bray and Jongtae Lim eds. Science and Confucian Statecraft in East Asia, pp. 147-189, Leiden and Boston: Brill, 2019.
3. “Water Management and the Legitimization of the Yongle Reign, 1403-1424: An Approach of Political Ecology,” in T’sui-jung Liu ed. Local Realities and Environmental Changes in the History of East Asia, pp.51-87, New York and London: Routledge, 2016.
4. 〈新近面世秦檜「宣聖七十二賢贊像」碑記〉，《宋史研究論文集》，鄭州：河南大學出版社，2014，頁178-188。(與Charles Hartman教授合著)
5. 〈人文學科在大學中的位置――紀念梅貽琦校長〉，國立清華大學教務處編，《梅貽琦校長逝世五十週年紀念會論文集》，新竹：清大出版社，2013，頁197-206。

（3）學術出版品編輯（Academic publications editor）：

1. 「宋代研究專號」二，《清華學報》51:2，(June 2021)。
2. 「宋代研究專號」一，《清華學報》51:1，(March 2021)。
3. 「王國斌專題：明清中國與全球史的連結」，《文化研究》19 (April 2015)。
4. 《錢新祖集》第一卷、第二卷，台北：台灣大學出版社，2013。（與鐘月岑、宋家復、陳秀芬合編）

（二）學術社群服務（Services）：

（1）各種委員會（Committees）：

1. 國立清華大學出版社，社務委員(2023-2025)
2. 國立清華大學發展策略規劃小組，委員(2022)
3. 國立清華大學清華學院教師評審委員會，委員(2022-2023)
4. 國立清華大學通識中心教師評審委員會，委員(2022-2024)
5. 國立清華大學特別學術審查委員會，委員(2022)
6. 國立清華大學校級課程委員會，委員(2021-2022)
7. 國立清華大學通識教育會議，委員(2021-present)
8. 明代研究學會，常務理事 (2020-present)
9. Member of Executive Editorial Board, Journal of Song Yuan Studies (2019-present)
10. 《新史學》編輯委員 (2019)
11. 《明代研究》，編纂委員 (2019)
12. 國立交通大學，文化研究國際中心，執行委員 (2018-2021)
13. 國立交通大學，文化研究國際中心，副主任 (2018-2021)
14. 科技部人文社會科學研究中心，「學術性專書補助」歷史學門審查委員 (2018)
15. 清華大學清華學院寫作中心諮議委員 (2018)
16. 《清華學報》編輯委員 (2017-2021)
17. 國立清華大學跨院國際博士班學位學程，約聘及兼任教師聘審委員、執行委員、課程委員 (2016-2018)
18. 《新史學》編輯委員 (2015)
19. 國立清華大學研究發展會議，委員 (2014-2015, 2022)
20. 國立清華大學議事法規組，委員 (2014)
21. 國立清華大學校務發展委員會，委員 (2014-2015)
22. 《明代研究》，編纂委員，(2014-2016)
23. 國立清華大學校務會議，委員 (2013-2015, 2016-2018)
24. Reviewer, Asian Social Studies (2013-2017)
25. 國立清華大學檔案鑑定小組，委員 (2013-2015)
26. 國立清華大學科技與社會跨領域獎學金，評審委員 (2013-2015, 2017)
27. 台聯大系統文化研究國際中心‧亞際文化研究國際碩士學位學程，學程委員 (2012-present)
28. 國立清華大學亞太／文化研究中心，召集人 (2012-2015, 2016-2019)
29. 國立清華大學教學發展中心‧學習促進與研究規劃組，組長 (2012.2.1.-2012.11.30.)
30. 《文化研究》編輯委員 (2011-2023)
31. 國立清華大學圖書委員會，委員 (2010-2011)
32. 《新史學》社員 (2010-present)
33. 明代研究學會理事 (2010-present)

（2）學術基金會（Academic Foundation）：

1. 財團法人梅貽琦先生紀念學術基金會，董事 (2022-2024)

（三）學術奬勵（Academic Awards）：

1. 2023-2026　國科會學術專書寫作計畫「宋代「真儒」論述與士人群體分化競合之軌跡」獎助 (NSTC 112-2410-H-007 -069 -MY3)
2. 2022-2023　科技部111年度(第60屆)補助科學與技術人員國外短期研究補助（因奉命接任國立清華大學人文社會學院院長而註銷此一補助案）
3. 2020-2022　科技部研究計畫「北宋「真儒」用例及其政治與文化意涵」獎助 (MOST 109-2410-H-007 -057 -MY2)
4. 2018.5-2019.12.　國立清華大學「競爭型研究團隊」計畫：「喧嘩的伏流：從異質性重看宋代士人文化」，計畫總主持人
5. 2018  國立清華大學106學年度傑出教學獎
6. 2018-2019　文化研究國際中心（教育部深耕計畫）子計畫「記憶政治與治理技藝：亞際社會的國家、民族與歷史」分項計畫「因戰爭錯／重置人群之經驗、記憶與書寫」主持人
7. 2018-present　國立清華大學延攬及留住特殊優秀人才獎勵
8. 2017-2020　科技部研究計畫「北宋前期南唐與吳越遺民之歷史書寫」獎助 (MOST 106-2410-H-007-050-MY3)
9. 2017　國立清華大學106年績優教研人員獎勵
10. 2016　國立清華大學105年績優教研人員獎勵
11. 2015-2016　頂尖大學策略聯盟選送加州大學（柏克萊）進修研究
12. 2015-2016　Senior Fulbright Research Grant 傅爾布萊特資深學者獎助
13. 2015　國立清華大學104年績優教研人員獎勵
14. 2014-2015　科技部人文社會研究中心「士人與近世社會文化變遷 (1100-1500)」標竿計畫，共同召集人
15. 2013　國立清華大學102年教師學術卓越獎勵
16. 2012　國立清華大學101年教師學術卓越獎勵
17. 2011-2014　國家科學會委員會獎助－優秀年輕學者研究計畫「題跋中的聲音：明初文人對宋金關係及對宋元明易代與變遷的思考」（NCS 100-2628-H-007 -019 –MY3）
18. 2011 竺可楨科學史獎 (Zhu Kezhen Award) (Awarded by International Society for the History of East Asian Science, Technology, and Medicine)
19. 2011　AAS-CIAC Small Grant (“Association for Asian Studies” 美國亞洲研究學會and “China and Inner Asia Council” 中國與中亞研究委員會)
20. 2009-2011　國家科學會委員會獎助（NCS 98-2410-H-007 -078 –MY2）
21. 2009-2011　國立清華大學增能計畫獎助（98N2919E1）
22. 2011　國立清華大學優良教師獎
23. 2011　國立清華大學新聘教師激勵研究專案補助
24. 2011　國立清華大學100年教師學術卓越獎勵
25. 2006-2007　蔣經國基金會獎學金 (Chiang Ching-Kuo Foundation Fellowship)
26. 2006-2007　Graduate Society Dissertation Completion Fellowship, GSAS, Harvard University
27. 1997-2000　Harvard-Yenching Institute Fellowship, Harvard University
28. 1997-1999　Fulbright Scholarship 傅爾布萊特獎學金